MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ehrlichia canis str. Jake chromosome

Total Repeats: 25332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007354	TGAA	2	8	472	479	50 %	25 %	25 %	0 %	73666634
2	NC_007354	ATG	2	6	494	499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666634
3	NC_007354	AAT	2	6	528	533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666634
4	NC_007354	CT	3	6	556	561	0 %	50 %	0 %	50 %	73666634
5	NC_007354	ATC	2	6	597	602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666634
6	NC_007354	AGG	2	6	634	639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73666634
7	NC_007354	ACA	2	6	674	679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666634
8	NC_007354	TAA	2	6	710	715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666634
9	NC_007354	CA	3	6	738	743	50 %	0 %	0 %	50 %	73666634
10	NC_007354	A	6	6	817	822	100 %	0 %	0 %	0 %	73666634
11	NC_007354	A	7	7	828	834	100 %	0 %	0 %	0 %	73666634
12	NC_007354	ACA	2	6	913	918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666634
13	NC_007354	CTA	2	6	919	924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666634
14	NC_007354	ACT	2	6	930	935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666634
15	NC_007354	CTG	2	6	941	946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73666634
16	NC_007354	ATTA	2	8	991	998	50 %	50 %	0 %	0 %	73666634
17	NC_007354	ATT	2	6	1001	1006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666634
18	NC_007354	AC	3	6	1035	1040	50 %	0 %	0 %	50 %	73666634
19	NC_007354	ATC	2	6	1043	1048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666634
20	NC_007354	ATG	2	6	1109	1114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666634
21	NC_007354	ACAA	2	8	1138	1145	75 %	0 %	0 %	25 %	73666634
22	NC_007354	A	6	6	1144	1149	100 %	0 %	0 %	0 %	73666634
23	NC_007354	TTA	2	6	1190	1195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666634
24	NC_007354	A	8	8	1205	1212	100 %	0 %	0 %	0 %	73666634
25	NC_007354	AT	4	8	1289	1296	50 %	50 %	0 %	0 %	73666634
26	NC_007354	GCA	2	6	1324	1329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73666634
27	NC_007354	CATT	2	8	1330	1337	25 %	50 %	0 %	25 %	73666634
28	NC_007354	TAG	2	6	1391	1396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666634
29	NC_007354	ATA	2	6	1397	1402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666634
30	NC_007354	A	6	6	1452	1457	100 %	0 %	0 %	0 %	73666634
31	NC_007354	GATA	2	8	1468	1475	50 %	25 %	25 %	0 %	73666634
32	NC_007354	TAC	2	6	1503	1508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666634
33	NC_007354	TTGTA	2	10	1539	1548	20 %	60 %	20 %	0 %	73666634
34	NC_007354	AAG	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666634
35	NC_007354	TA	3	6	1571	1576	50 %	50 %	0 %	0 %	73666634
36	NC_007354	A	6	6	1599	1604	100 %	0 %	0 %	0 %	73666634
37	NC_007354	ATCA	2	8	1653	1660	50 %	25 %	0 %	25 %	73666635
38	NC_007354	ATT	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666635
39	NC_007354	CA	3	6	1695	1700	50 %	0 %	0 %	50 %	73666635
40	NC_007354	TTAT	2	8	1720	1727	25 %	75 %	0 %	0 %	73666635
41	NC_007354	T	6	6	1756	1761	0 %	100 %	0 %	0 %	73666635
42	NC_007354	TTC	2	6	1773	1778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73666635
43	NC_007354	TAAAGT	2	12	1796	1807	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73666635
44	NC_007354	ATTATA	2	12	1809	1820	50 %	50 %	0 %	0 %	73666635
45	NC_007354	TTA	2	6	1837	1842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666635
46	NC_007354	AC	3	6	1866	1871	50 %	0 %	0 %	50 %	73666635
47	NC_007354	CAAA	2	8	1877	1884	75 %	0 %	0 %	25 %	73666635
48	NC_007354	A	6	6	1890	1895	100 %	0 %	0 %	0 %	73666635
49	NC_007354	AATT	2	8	1904	1911	50 %	50 %	0 %	0 %	73666635
50	NC_007354	TAAT	2	8	1943	1950	50 %	50 %	0 %	0 %	73666635
51	NC_007354	A	6	6	1965	1970	100 %	0 %	0 %	0 %	73666635
52	NC_007354	TAA	2	6	1999	2004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666635
53	NC_007354	CAC	2	6	2005	2010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73666635
54	NC_007354	TATAAA	2	12	2021	2032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666635
55	NC_007354	TTCC	2	8	2075	2082	0 %	50 %	0 %	50 %	73666635
56	NC_007354	AATAAA	2	12	2091	2102	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	73666635
57	NC_007354	GAA	2	6	2104	2109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666635
58	NC_007354	A	6	6	2130	2135	100 %	0 %	0 %	0 %	73666635
59	NC_007354	AAC	2	6	2142	2147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666635
60	NC_007354	T	6	6	2161	2166	0 %	100 %	0 %	0 %	73666635
61	NC_007354	A	6	6	2195	2200	100 %	0 %	0 %	0 %	73666635
62	NC_007354	TAA	2	6	2604	2609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666636
63	NC_007354	GCA	2	6	2678	2683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73666636
64	NC_007354	TTA	2	6	2754	2759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666636
65	NC_007354	CAT	2	6	2807	2812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666636
66	NC_007354	TAA	2	6	2826	2831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666636
67	NC_007354	A	6	6	2877	2882	100 %	0 %	0 %	0 %	73666636
68	NC_007354	GAT	2	6	2924	2929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666636
69	NC_007354	AATGG	2	10	2981	2990	40 %	20 %	40 %	0 %	73666636
70	NC_007354	GCA	2	6	3013	3018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73666636
71	NC_007354	AGG	2	6	3022	3027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73666636
72	NC_007354	AGAA	2	8	3070	3077	75 %	0 %	25 %	0 %	73666636
73	NC_007354	GAT	2	6	3125	3130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666636
74	NC_007354	AAC	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666636
75	NC_007354	AAC	2	6	3159	3164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666636
76	NC_007354	GT	3	6	3245	3250	0 %	50 %	50 %	0 %	73666636
77	NC_007354	A	7	7	3264	3270	100 %	0 %	0 %	0 %	73666636
78	NC_007354	AGC	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73666636
79	NC_007354	CGTA	2	8	3379	3386	25 %	25 %	25 %	25 %	73666636
80	NC_007354	TGT	2	6	3401	3406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73666636
81	NC_007354	TA	3	6	3411	3416	50 %	50 %	0 %	0 %	73666636
82	NC_007354	AGA	2	6	3478	3483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666637
83	NC_007354	ACC	2	6	3487	3492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73666637
84	NC_007354	A	7	7	3535	3541	100 %	0 %	0 %	0 %	73666637
85	NC_007354	ACA	2	6	3618	3623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666637
86	NC_007354	TCA	2	6	3635	3640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666637
87	NC_007354	AAAAG	2	10	3653	3662	80 %	0 %	20 %	0 %	73666637
88	NC_007354	CAG	2	6	3675	3680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73666637
89	NC_007354	AAAG	2	8	3706	3713	75 %	0 %	25 %	0 %	73666637
90	NC_007354	TAA	2	6	3715	3720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
91	NC_007354	TAA	2	6	3735	3740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
92	NC_007354	ATG	2	6	3756	3761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666637
93	NC_007354	TAT	2	6	3767	3772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666637
94	NC_007354	AAC	2	6	3785	3790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666637
95	NC_007354	AAAT	2	8	3795	3802	75 %	25 %	0 %	0 %	73666637
96	NC_007354	TCA	2	6	3818	3823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666637
97	NC_007354	A	7	7	3860	3866	100 %	0 %	0 %	0 %	73666637
98	NC_007354	TAA	2	6	3906	3911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
99	NC_007354	A	9	9	4045	4053	100 %	0 %	0 %	0 %	73666637
100	NC_007354	AAG	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666637
101	NC_007354	CAA	2	6	4097	4102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666637
102	NC_007354	GAA	2	6	4118	4123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666637
103	NC_007354	AAT	2	6	4124	4129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
104	NC_007354	AAT	2	6	4142	4147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
105	NC_007354	GCT	2	6	4280	4285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73666637
106	NC_007354	GGT	2	6	4292	4297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73666637
107	NC_007354	TTA	2	6	4311	4316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666637
108	NC_007354	ATG	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666637
109	NC_007354	TAA	2	6	4344	4349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
110	NC_007354	T	6	6	4393	4398	0 %	100 %	0 %	0 %	73666637
111	NC_007354	AATA	2	8	4399	4406	75 %	25 %	0 %	0 %	73666637
112	NC_007354	A	6	6	4447	4452	100 %	0 %	0 %	0 %	73666637
113	NC_007354	TAG	2	6	4503	4508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666637
114	NC_007354	TTC	2	6	4543	4548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73666637
115	NC_007354	TAA	2	6	4551	4556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
116	NC_007354	ATT	2	6	4634	4639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666637
117	NC_007354	GGA	2	6	4640	4645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73666637
118	NC_007354	CAA	2	6	4710	4715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666637
119	NC_007354	A	7	7	4720	4726	100 %	0 %	0 %	0 %	73666637
120	NC_007354	CTT	2	6	4734	4739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73666637
121	NC_007354	AAG	2	6	4843	4848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666637
122	NC_007354	TTA	2	6	4863	4868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666637
123	NC_007354	ATT	2	6	4874	4879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666637
124	NC_007354	TAG	2	6	4911	4916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666637
125	NC_007354	A	7	7	4953	4959	100 %	0 %	0 %	0 %	73666637
126	NC_007354	CAA	2	6	4966	4971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666637
127	NC_007354	A	6	6	4993	4998	100 %	0 %	0 %	0 %	73666637
128	NC_007354	AGA	2	6	5000	5005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666637
129	NC_007354	ATT	2	6	5012	5017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666637
130	NC_007354	T	6	6	5016	5021	0 %	100 %	0 %	0 %	73666637
131	NC_007354	T	7	7	5033	5039	0 %	100 %	0 %	0 %	73666637
132	NC_007354	AGA	2	6	5065	5070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666637
133	NC_007354	AGA	2	6	5080	5085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666637
134	NC_007354	TAA	2	6	5088	5093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
135	NC_007354	AAT	2	6	5120	5125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
136	NC_007354	ATA	2	6	5132	5137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
137	NC_007354	AAGA	2	8	5138	5145	75 %	0 %	25 %	0 %	73666637
138	NC_007354	AAC	2	6	5177	5182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666637
139	NC_007354	ATA	2	6	5192	5197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
140	NC_007354	AGA	2	6	5233	5238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666637
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271	NC_007354	ACA	2	6	12154	12159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666644
272	NC_007354	ATTC	2	8	12167	12174	25 %	50 %	0 %	25 %	73666644
273	NC_007354	TCC	2	6	12248	12253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73666644
274	NC_007354	TCT	2	6	12291	12296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73666644
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408	NC_007354	TCA	2	6	18034	18039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666650
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411	NC_007354	TCA	2	6	18142	18147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666650
412	NC_007354	AGA	2	6	18210	18215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666650
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